18 Декабря 2017 Пн

Информационный портал районной газеты Коньково ЮЗАО г.Москвы

Определена дата встречи с главой управы 20 декабря в 19.00 по адресу: Коньково - ул. Академика Арцимовича, д. 7 (школа № 113). Тема встречи: о мероприятиях по празднованию Нового года и Рождества;

Ученые из Конькова создали "ядовитую" базу данных


24 Июня 2016

Сотрудники Института биоорганической химии создали базу данных пептидных токсинов из яда скорпионов – Kalium. Она поможет учёным систематизировать информацию о молекулах, блокирующих калиевые каналы. 

Кроме того, подобная база данных станет полезным инструментом для дальнейшего изучения самих каналов, которые сегодня считаются фармакологической мишенью при некоторых аутоиммунных, онкологических и нейродегенеративных заболеваниях. Результаты работы опубликованы в журнале Database: The Journal of Biological Databases and Curation.

Как пояснил Алексей Кузьменков, сотрудник группы молекулярных инструментов для нейробиологии ИБХ РАН, первый автор статьи, в базе данных Kalium находятся все известные в настоящее время пептидные молекулы яда скорпионов, действующие на калиевые каналы. База данных хорошо подходит как для фундаментальных исследований, так и для практических задач, например, при создании лекарственных препаратов.

База данных Kalium – набор информации о пептидных токсинах, действующих на калиевые каналы и выделенных из яда скорпионов, а это половина всех известных пептидных блокаторов этих каналов. Попадая в организм, они избирательно воздействуют на определенные ионные каналы – мембранные белки, которые играют ведущую роль в передаче сигналов в нервной системе. Нарушение работы этих белков приводит к различным заболеваниям, поэтому они считаются важными фармакологическими мишенями.

Поскольку калиевые каналы являются самым представленным суперсемейством ионных каналов, систематизация актуальной информации о молекулах, действующих на них, предтавляет собой интересную и актуальную задачу современной биоорганической химии и фармакологии.

В настоящее время база данных Kalium содержит 174 токсина, существование которых подтверждено на уровне белка, то есть они были выделены непосредственно из животных или получены генно-инженерным способом. Алексей с коллегами собирали информацию из разных баз данных и научных публикаций. Из Kalium легко можно перейти в другие базы данных, такие как NCBITaxonomyBrowser, Uniprot и базу данных пространственных структур PDB.

В ближайшее время исследователи планируют дополнить Kalium пептидами, выделенными из других животных: пауков, конусов (хищных моллюсков), анемон (коралловых полипов), пчёл и змей. Таким образом, Kalium охватит обширную группу молекул, действующих на ионные каналы.

Теги:  Коньково, яды, биология, ученые, наука, исследования, Институт биоорганической химии, ИБХ РАН