23 Мая 2018 Ср

Информационный портал районной газеты Коньково ЮЗАО г.Москвы

...

Ученые из Конькова создали "ядовитую" базу данных


24 Июня 2016

Сотрудники Института биоорганической химии создали базу данных пептидных токсинов из яда скорпионов – Kalium. Она поможет учёным систематизировать информацию о молекулах, блокирующих калиевые каналы. 

Кроме того, подобная база данных станет полезным инструментом для дальнейшего изучения самих каналов, которые сегодня считаются фармакологической мишенью при некоторых аутоиммунных, онкологических и нейродегенеративных заболеваниях. Результаты работы опубликованы в журнале Database: The Journal of Biological Databases and Curation.

Как пояснил Алексей Кузьменков, сотрудник группы молекулярных инструментов для нейробиологии ИБХ РАН, первый автор статьи, в базе данных Kalium находятся все известные в настоящее время пептидные молекулы яда скорпионов, действующие на калиевые каналы. База данных хорошо подходит как для фундаментальных исследований, так и для практических задач, например, при создании лекарственных препаратов.

База данных Kalium – набор информации о пептидных токсинах, действующих на калиевые каналы и выделенных из яда скорпионов, а это половина всех известных пептидных блокаторов этих каналов. Попадая в организм, они избирательно воздействуют на определенные ионные каналы – мембранные белки, которые играют ведущую роль в передаче сигналов в нервной системе. Нарушение работы этих белков приводит к различным заболеваниям, поэтому они считаются важными фармакологическими мишенями.

Поскольку калиевые каналы являются самым представленным суперсемейством ионных каналов, систематизация актуальной информации о молекулах, действующих на них, предтавляет собой интересную и актуальную задачу современной биоорганической химии и фармакологии.

В настоящее время база данных Kalium содержит 174 токсина, существование которых подтверждено на уровне белка, то есть они были выделены непосредственно из животных или получены генно-инженерным способом. Алексей с коллегами собирали информацию из разных баз данных и научных публикаций. Из Kalium легко можно перейти в другие базы данных, такие как NCBITaxonomyBrowser, Uniprot и базу данных пространственных структур PDB.

В ближайшее время исследователи планируют дополнить Kalium пептидами, выделенными из других животных: пауков, конусов (хищных моллюсков), анемон (коралловых полипов), пчёл и змей. Таким образом, Kalium охватит обширную группу молекул, действующих на ионные каналы.

Теги:  Коньково, яды, биология, ученые, наука, исследования, Институт биоорганической химии, ИБХ РАН